Char Leung PhD
Universidad de Deakin, 221 Burwood Highway, 3125, Australia
Correo electrónico: char.leung@deakin.edu.au
Running head: El período de incubación del SARS-CoV-2
Conflicto de intereses: el autor declara no tener ningún conflicto de intereses.
Recuento de palabras: 1240 (en su original en inglés)
Introducción
Una epidemia de neumonía viral comenzó en Wuhan, la capital de la provincia de Hubei en China, en diciembre de 2019. La Organización Mundial de la Salud identificó y nombró un nuevo coronavirus como SARS-CoV-2. Se ha encontrado que es genéticamente similar al SARS-CoV y MERS-CoV1. Recientemente, se ha sugerido que las serpientes son los reservorios naturales del SARS-CoV-2, suponiendo que el mercado mayorista de mariscos de Huanan en Wuhan es el origen del virus2.
Las autoridades sanitarias han implementado diferentes medidas preventivas, siendo la cuarentena de 14 días la más utilizada. Si bien estudios anteriores han estimado el período de incubación del SARS-CoV-2 para ayudar a determinar la duración de la cuarentena, recientemente se ha observado que algunos pacientes tenían síntomas leves, como tos y fiebre leve o incluso ningún síntoma3, y que el período de incubación podría haber sido de 24 días4, lo que constituye una amenaza mayor para la efectividad de la detección. En este contexto, el presente trabajo estimó la distribución de los períodos de incubación de pacientes infectados dentro y fuera de Hubei.
Métodos
Debido a que los detalles de la mayoría de los casos fueron informados por los medios y no estaban disponibles en las páginas web oficiales de las autoridades sanitarias locales en China, tres búsquedas de casos individuales informados por los medios entre el 20 de enero de 2020 y el 12 de febrero (los primeros casos fuera de Hubei informaron el 20 de enero de 2020) con los términos de búsqueda “neumonía” Y “Wuhan” Y “edad” Y “nuevo” en chino se realizaron en Google del 7, 8 y 9 de febrero. La inclusión del término de búsqueda "edad" tenía la intención de reducir los resultados de búsqueda ya que la presencia de "edad" en un artículo implicaba una descripción de un caso individual.
Los casos individuales con tiempo de exposición y aparición de síntomas, así como el tipo de exposición, fueron elegibles para su inclusión. No hubo restricción de idioma. Como la mayoría de los pacientes no tenían información completa sobre la fuente de infección, se permitió que el tiempo de exposición fuera un intervalo de tiempo dentro del cual se creía que estaba la exposición. Por el contrario, los pacientes podían recordar la fecha exacta de inicio de los síntomas. El presente trabajo consideró dos tipos de exposición, (i) viajar a Hubei, China, y (ii) contacto con la fuente de infección, como una persona infectada o lugares donde se alojaron agentes infecciosos. Para la precisión de los datos, solo se consideraron casos confirmados fuera de la provincia de Hubei y dentro de China.
Se resumieron los siguientes datos, (i) ubicación en la que se confirmó el caso, (ii) sexo, (iii) edad, (iv) tiempo de exposición, (v) hora del primer inicio de síntomas, (vi) tipo de exposición ( viajero a Hubei y no viajero) y (vii) síntomas.
La distribución del período de incubación se estimó utilizando la máxima verosimilitud (MLE) donde la función de verosimilitud de cada observación en el conjunto de datos es exacta o censurada por intervalo único 5. Para un caso individual con tiempo exacto de exposición y síntomas, la función de verosimilitud para un la observación exacta del período de incubación, T, fue
, donde f y
fueron el PDF del período de incubación y el conjunto de parámetros, respectivamente. Para un caso individual con exposición entre
, la función de probabilidad para una observación de incubación fue 
donde F y S fueron el CDF del período de incubación y el momento del inicio de los síntomas, respectivamente. Por lo tanto, para encontrar las estimaciones de máxima verosimilitud de
, los máximos de la suma de las funciones individuales de probabilidad logarítmica, ya sea
o
dependiendo del tipo de datos de la observación, se calcularon con el software R.
Se supuso que T seguía la distribución lognormal, Weibull y gamma. Para determinar la posible diferencia en la distribución entre el grupo viajero y no viajero, adjusted se ajustó mediante la inclusión de parámetros adicionales y variables indicadoras que tomaron el valor 0 o 1 para indicar el tipo de exposición. Por ejemplo, la
para una distribución lognormal está dada por
donde D es la variable indicadora.
para una distribución lognormal está dada por
donde D es la variable indicadora.
Resultados
Google generó un total de 1457 resultados. Ciento setenta y cinco casos de 64 páginas web fueron elegibles para su inclusión. Todos los pacientes pudieron recordar los datos del inicio de los síntomas. Cincuenta y un pacientes pudieron recordar la fecha exacta de exposición. Muchos de estos pacientes permanecieron en Hubei por un día, o tuvieron una reunión de amigos o familiares en un día en particular. Los 124 pacientes restantes solo pudieron recordar que el intervalo de tiempo de exposición fue en gran parte a Hubei para hacer turismo, visitar el trabajo o la familia, o vivieron con un familiar infectado.
De los 151 casos con sexo revelado, 93 eran hombres (61,6%, IC 95% 53,3% -69,4%). La edad promedio fue de 41.2 años (IC 95% 38.8-43.5). Los viajeros a Hubei representaron el 59.8% (IC 95% 49.3% -69.6%). Con la excepción del frío (p = 0.04997), no hubo diferencias en las características clínicas entre los dos grupos. Fiebre (81.6% para viajeros y 82.8 para no viajeros) y tos (40.6% para viajeros y 44.8 para no viajeros) fueron los síntomas más comunes independientemente del tipo de exposición.
Los resultados de la estimación de máxima verosimilitud se muestran en la Tabla 1. La AIC sugirió que la distribución de Weibull proporcionó el mejor ajuste a los datos. Ambas variables indicadoras de los parámetros de forma y escala fueron significativas en el modelo de Weibull, lo que sugiere diferentes distribuciones del período de incubación entre los dos grupos de pacientes.
Tabla 1. Resultados de la estimación de máxima verosimilitud
Nota: * Significativamente diferente de cero por debajo del 5% ** cuanto menor sea el mejor ajuste a los datos
Discusión
La primera observación del período de incubación del SARS-CoV-2 provino de la Comisión Nacional de Salud de China, informando un tiempo de incubación entre 1 y 14 días6. La estimación estadística de la distribución de los períodos de incubación se ha realizado en otros dos estudios7,8.
El presente estudio exploró la diferencia en los períodos de incubación entre los diferentes grupos de pacientes. Los datos clínicos se recopilaron de los casos individuales informados por los medios de comunicación, ya que no estaban completamente disponibles en las páginas oficiales de las autoridades sanitarias chinas. MLE se utilizó para estimar las distribuciones del período de incubación.
El presente trabajo encontró diferencias significativas en la distribución del período de incubación entre viajeros a Hubei y no viajeros. La diferencia se debió tanto a la ubicación como a la variabilidad, como lo indican los medios de 1.8 y 7.2 días y las variaciones de 0.7 y 16.2 en el modelo de Weibull. Tal diferencia podría deberse a la diferencia en la dosis infecciosa ya que los viajeros a Hubei podrían ser expuestos a diferentes fuentes de infección varias veces durante su estadía en Hubei. En contraste, los pacientes sin antecedentes de viaje a Hubei fueron expuestos temporalmente a sus familiares, amigos o colegas infectados con síntomas leves o incluso sin síntomas.
Es posible que el período de incubación de los no viajeros fuera altamente volátil, como lo sugiere la mayor variación en el modelo gamma que proporcionó un ajuste ligeramente peor. Esto podría representar una amenaza para la efectividad de las medidas preventivas existentes. La duración del período de cuarentena debe considerarse con precaución.
A modo de comparación, los estudios previos sobre el período de incubación del SARS-CoV-2 se muestran en la Tabla 2. Los percentiles 95 informados en estudios anteriores variaron entre 10.3 y 13.3 días, de acuerdo con la práctica actual del período de cuarentena de 2 semanas. Sin embargo, el presente estudio encontró que el percentil 95 de los no viajeros podría ser de 14,6 días y hasta 17,1 días con un nivel de confianza del 95%. Junto con la alta variabilidad del período de incubación, se sugiere que la duración del período de cuarentena de 3 semanas se considere más adecuada.
Tabla 2. Períodos de incubación estimados para SARS-CoV-2 de diferentes estudios
Referencias
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- Ji W, Wang W, Zhao X, et al. Homologous recombination within the spike glycoprotein of the newly identified coronavirus may boost cross‐species transmission from snake to human. J Med Virol 2020. doi:10.1002/jmv.25682
- Chan JF, Yuan S, Kok K, et al. A familial cluster of pneumonia associated with the 2019 novel coronavirus indicating person-to-person transmission: a study of a family cluster. Lancet2020. doi:10.1016/S0140-6736(20)30154-9
- Guan W, Ni Z, Hu Y, et al. Clinical characteristics of 2019 novel coronavirus infection in China.medRxiv 2020, doi:10.1101/2020.02.06.20020974
- Reich NG, Lessler J, Cummings DAT, et al. Estimating incubation period distributions with coarse data. Stat Med 2009;28(22):2769–2784. doi:10.1002/sim.3659
- National Health Committee of the PRC Government (2020, January 26). State Council Information Office Press Conference. http://www.nhc.gov.cn/xwzb/webcontroller.do?titleSeq=11209&gecstype=1. Accessed 9 February 2020.
- Li Q, Guan X, Wu P, et al. Early Transmission Dynamics in Wuhan, China, of Novel Coronavirus–Infected Pneumonia. N Engl J Med 2020. doi:10.1056/NEJMoa2001316
- Backer JA, Klinkenberg D, Wallinga J. Incubation period of 2019 novel coronavirus (COVID- 19) infections among travellers from Wuhan, China. Eurosurveil 2020. doi:10.2807/1560- 7917.ES.2020.25.5.2000062
Este es un manuscrito aceptado para el control de infecciones y la epidemiología hospitalaria como parte de la Colección Cambridge Coronavirus.
DOI: 10.1017 / hielo.2020.81
Recuperado de https://www.cambridge.org/core/services/aop-cambridge-core/content/view/AB1FB7B5B94F5ED63408D86D43087239/S0899823X20000811a.pdf/difference_in_the_incubation_period_of_2019_novel_coronavirus_sarscov2_infection_between_travelers_to_hubei_and_nontravelers_the_need_of_a_longer_quarantine_period.pdf


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